一、商鋪租賃合同中違章搭建合同是否有效

違章搭建的商鋪租賃合同無效。
違章搭建的商鋪是指該建筑物不具備建設工程規(guī)劃許可證或者未按照建設工程規(guī)劃許可證的規(guī)定建設的房屋，出租人就此種房屋與承租人訂立的租賃合同無效。但在一審法庭辯論終結(jié)前取得建設工程規(guī)劃許可證或者經(jīng)主管部門批準建設的，人民法院應當認定有效。
《最高人民法院關于審理城鎮(zhèn)房屋租賃合同糾紛案件具體應用法律若干問題的解釋》第二條

引用法規(guī)
[1]《最高人民法院關于審理城鎮(zhèn)房屋租賃合同糾紛案件具體應用法律若干問題的解釋》 第二條

二、租賃違建合同是否有效呢

違法建筑物租賃合同無效。依據(jù)法律規(guī)定，在城市、鎮(zhèn)規(guī)劃區(qū)內(nèi)進行建筑物建設的，建設單位應當申請辦理建設工程規(guī)劃許可證。租賃的標的物屬于違法建筑，合同約定違反了法律、行政法規(guī)的強制性規(guī)定，因此該租賃合同無效。行為人因該行為取得的財產(chǎn)，應當予以返還；不能返還或者沒有必要返還的，應當折價補償。
【法律依據(jù)】
《民法典》第一百四十三條，具備下列條件的民事法律行為有效
（一）行為人具有相應的民事行為能力；
（二）意思表示真實；
（三）不違反法律、行政法規(guī)的強制性規(guī)定，不違背公序良俗。

引用法規(guī)
[1]《民法典》 第一百四十三條

三、違章建筑房屋租賃合同有效嗎？

無效。依據(jù)最高人民法院《關于審理城鎮(zhèn)房屋租賃合同糾紛案件具體應用法律若干問題的解釋》，違法建筑物的租賃合同是無效的，在違法建筑物范圍認定上，確定未取得建設工程規(guī)劃許可證或者未按照建設工程規(guī)劃許可證規(guī)定建設的“房屋”，未經(jīng)批準或者未按照批準建設的臨時建筑，超過批準使用期限的臨時建筑為違法建筑。
此外，未經(jīng)合法批準建造的房屋，因其標的物具有違法性，該租賃合同應為無效。如被行政部門確定為違章建筑的或所建造的房屋沒有合法審批手續(xù)的等。

四、租賃合同違約時扣押金是否合法

合同違約如果雙方約定了押金作為違約金的，可以扣除押金。如果沒有約定押金作為違約金的，應當返還押金，并且依照合同約定的違約金進行支付，約定的違約金低于造成的損失的，人民法院或者仲裁機構可以根據(jù)當事人的請求予以增加；約定的違約金過分高于造成的損失的，人民法院或者仲裁機構可以根據(jù)當事人的請求予以適當減少。如果雙方?jīng)]有約定違約金的，可以按照實際造成的損失承擔違約責任。
【法律依據(jù)】
《民法典》第五百八十五條，當事人可以約定一方違約時應當根據(jù)違約情況向?qū)Ψ街Ц兑欢〝?shù)額的違約金，也可以約定因違約產(chǎn)生的損失賠償額的計算方法。
約定的違約金低于造成的損失的，人民法院或者仲裁機構可以根據(jù)當事人的請求予以增加；約定的違約金過分高于造成的損失的，人民法院或者仲裁機構可以根據(jù)當事人的請求予以適當減少。
當事人就遲延履行約定違約金的，違約方支付違約金后，還應當履行債務。

引用法規(guī)
[1]《民法典》 第五百八十五條

五、房屋違建的租賃合同是否有效房屋違建立為是否有效？

無效。依據(jù)最高人民法院《關于審理城鎮(zhèn)房屋租賃合同糾紛案件具體應用法律若干問題的解釋》，違法建筑物的租賃合同是無效的，在違法建筑物范圍認定上，確定未取得建設工程規(guī)劃許可證或者未按照建設工程規(guī)劃許可證規(guī)定建設的“房屋”，未經(jīng)批準或者未按照批準建設的臨時建筑，超過批準使用期限的臨時建筑為違法建筑。
此外，未經(jīng)合法批準建造的房屋，因其標的物具有違法性，該租賃合同應為無效。如被行政部門確定為違章建筑的或所建造的房屋沒有合法審批手續(xù)的等。
《關于審理城鎮(zhèn)房屋租賃合同糾紛案件司法解釋的理解與適用》第三條

引用法規(guī)
[1]《關于審理城鎮(zhèn)房屋租賃合同糾紛案件司法解釋的理解與適用》 第三條